国家博物馆乞那吞密是因乞那吞密（那姆·苏塔托）王子曾任乞那吞省的主教和พระบรมธาตุวรวิหาร的前住持的兴趣而成立的。他收集了在乞那吞省及其周边地区发现的大量艺术品和古物，并将其保存在寺庙的博物馆中。后来，乞那吞密尊者愉快地将这些艺术品和古物赠予国家，以促进泰国历史和考古学的教育。因此，在公元1966年，文化部开始在靠近พระบรมธาตุวรวิหาร的地区建设博物馆，并命名为国家博物馆乞那吞密，以纪念乞那吞密尊者。自1970年起，博物馆便向公众开放参观。